深圳海陆空铁口岸俱全，是中国拥有口岸数量最多、出入境人员最多、车流量最大的口岸城市。深圳海关直属中华人民共和国海关总署领导，业务管辖区域包括深圳市及惠州市。深圳口岸是全国最繁忙的口岸之一，深圳海关也是全国任务最繁重的海关之一。深圳海关为企业提供“24小时预约通关”等个性化服务。

 
深圳市边境是靠近香港新界北区的，包括罗湖区、盐田区、福田区及沿海的南山区，是中国拥有最多陆路口岸的城市，在深圳各处连接香港，市民及来访游客可以凭旅游证件方便来往深港两市之间。

从深圳市入境香港只需要十分钟时间办理出入境手续便可以进入香港边境管制站（禁区）转乘交通进入市区。深圳已建成通往境外的各类口岸18个，其中包括中国客流量最大的旅客出入境陆路口岸——罗湖口岸，24小时通关的皇岗口岸等。罗湖口岸、福田口岸均有深圳地铁罗宝线与香港地铁东铁线接驳。

深圳市边境口岸有：罗湖口岸、深圳湾口岸、福田口岸、皇岗口岸、文锦渡口岸、沙头角口岸、蛇口码头口岸（可供旅游人士入境香港转机出国的口岸）。